皇帝的位置可不是那么容易坐的，首先要解决六十万大军的吃饭问题。关中一带，土地荒芜，吃闲饭的多（达官贵人、禁军侍卫、皇孙公子、巨商大贾、各种艺人、工匠），种地、生产粮食的人少，往常时节，靠着南方江淮一带的粮食供应，京师长安这座寄生性大都市是可以存在的。

现在，黄巢一下子带来了这么多张嘴，靠什么来填呢？黄巢一路征战，曾经占据过长江、淮河、两湖、广州、福建等富庶之地，但是，农民军只不过是一场洪水或者是泥石流，水过地皮干，从来不能长期占据一地，也从来没有考虑过建立自己的钱粮供应基地，这种情况下，农民军要生存，只能是继续往前走，走一路、吃一路，所经之处，竭泽而渔，黄巢大军带来的破坏力是巨大的，这样一种破坏力量，不能转化为社会的安稳力量，更不能成为社会经济的建设者，黄巢是没有前途的，因为一个社会，破坏者成长的结果是毁灭，他的存在意味着他人的毁灭，那么，其他人就会联合起来，消灭这股力量。

黄巢数十万大军困在长安孤城，他发出的指令，得不到天下任何一个藩镇的响应，一个从社会底层爬上来的私盐贩子黄巢开始成为天下诸侯（藩镇）的众矢之的，因为谁在这场战争中行动快，就意味着捞到更大的地盘，控制更多的人口，就能成为天下霸主。

黄巢大军缺粮，各路藩镇的军队逐渐紧逼关中，黄巢出战不利。决定东去。

河南陈州的刺史预料到黄巢东去，陈州正好首当其冲，他动员陈州人提前做好准备，大家加固城墙，将城壕挖深，储备了大量的粮草、战甲、兵器，陈州城外六十里之内的人口、财物都搬进城中。

黄巢的大军离开长安后，他的爱将、农民军的先锋官孟楷率先来到陈州城下，陈州守军趁着孟楷大意，出城偷袭，将孟楷杀死。

黄巢大怒，率大军包围了陈州城，誓死为孟楷报仇，这次包围、进攻陈州城，前后长达三百天，陈州城未曾被攻下。农民军缺少粮食，就在周围几十里范围内捉拿百姓，将活人放进大石臼活活凿成肉饼，作为军粮，前后杀死的人口难以胜数，数百里之内没有人烟。

沙陀族的首领李克用统帅几万胡族骑兵组成的大军杀来，打败了黄巢，黄巢被迫从陈州城下撤走，各地的藩镇看到黄巢大势已去，纷纷出动军队围剿，黄巢的大将朱温、尚让等投降朝廷。

884年，黄巢败退到狼虎谷，黄巢身边只剩下很少人，黄巢的外甥林言斩下黄巢的头颅，将要进献给朝廷时，在半道被沙陀骑兵拦截，沙陀人抢走黄巢的头颅，并且杀死了林言。

黄巢在长安抢夺的很多美貌姬妾被俘，送到长安，唐僖宗也还都长安，唐僖宗责备这些女人说：“你们都是出身富贵人家，世代深受皇恩，为什么要委身贼寇呢？”